Болдырева, Л. В.
Эффект положения гена: роль локального окружения в регуляции активности генов / Л. В. Болдырева, Е. Н. Андреева, А. В. Пиндюрин. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 355-390. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 374-390 (429 назв.). - рис.

Авторы: Болдырева, Л. В., Андреева, Е. Н., Пиндюрин, А. В.

Аннотация: Рассмотрен феномен эффекта положения гена - явления, при котором уровень экспрессии одного и того же гена существенно зависит от его положения в геноме. Эффект положения гена заключается в изменении его эпигенетического состояния и является уникальным инструментом для исследования молекулярных и биохимических процессов. Понимание молекулярных механизмов эффекта положения гена у человека имеет важное значение в клинической сфере, в частности, для выявления и лечения ретровирусных инфекций, нейродегенеративных заболеваний. Кроме того, для полноценного применения методов генной терапии важно владеть знаниями и подходами, которые с достаточной точностью могут обеспечивать необходимый уровень экспрессии внедряемых трансгенов.

Экспрессия белка LAMP1 человека повышает продукцию вирусов SARS-COV-1 И SARS-COV-2 в трансгенных клеточных линиях на основе Vero / А. А Дольский, И. В. Грищенко, С. А. Боднев [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 503-509. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 508 (23 назв.). - рис.

Авторы: Дольский, А. А, Грищенко, И. В., Боднев, С. А., Назаренко, А. А., Смирнова, А. М., Матвеева, А. К., Булычев, Л. Е., Овчинникова, А. С., Трегубчак, Т. В., Зайковская, А. В., Иматдинов, И. Р., Пьянков, О. В., Гаврилова, Е. В., Максютов, Р. А, Юдкин, Д. В.

Аннотация: Созданы трансгенные клеточные линии на основе клеток Vero с повышенной экспрессией гена LAMP1 человека, проанализирована их чувствительность к заражению и репликативная активность SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2. Обнаружено повышение продукции обоих вирусов в трансгенных клетках по сравнению с исходной клеточной культурой, особенно при заражении клеток в присутствии трипсина. На основании полученных данных предположено, что LAMP1 способствует репликации SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 за счет усиления экзоцитоза.

Суперэнхансер KLF6 регулирует пролиферацию клеток гепатомы человека, рекрутируя GATA2 и SOX10 / Kum Chol Ri, Ri Myong Ryong, Kim Kwang Hun [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 498-499. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - ил.

Авторы: Kum Chol Ri, Ri Myong Ryong, Kim Kwang Hun, Choe Sunil, Ri Ju Hua, Kim Ji Hyon, Ri Jong Ho

Аннотация: Изучены функциональные свойства суперэнхансера гена KLF6, связанные с регуляцией роста клеток HepG2 и с взаимодействием с факторами транскрипции. Выявлено, что активность суперэнхансера KLF6 регулируется двумя факторами транскрипции (GATA2 и SOX10), воздействие на которые может быть потенциальной терапевтической стратегией при раке печени.

Пузаков, М. В.
Распространенность, разнообразие и эволюция ДНК-транспозонов L18 (DD37E) в геномах стрекающих (Cnidaria) / М. В. Пузаков, Л. В. Пузакова. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 476-490. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 487-489 (53 назв.). - рис., 3 табл.

Авторы: Пузаков, М. В., Пузакова, Л. В.

Аннотация: Изучены структура, распространение, разнообразие и эволюция элементов L18 (DD37E) в геномах стрекающих (Cnidaria). Установлено, что группа L18 является самостоятельным семейством (а не подсемейством семейства TLE, как считалось ранее), входящим в суперсемейство Tc1/mariner. Полученные данные дополняют знания о разнообразии и эволюции транспозонов Tc1/mariner и будут способствовать изучению влияния мобильных генетических элементов на эволюцию многоклеточных.

Полногеномное профилирование метилирования ДНК CD4+ T-лимфоцитов больных первично-прогрессирующим рассеянным склерозом свидетельствует о вовлеченности этого эпигенетического процесса в иммунопатогенез заболевания / И. С. Киселев, О. Г. Кулакова, Л. В. Данилова [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 468-475. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 474-475 (29 назв.). - рис., 2 табл.

Авторы: Киселев, И. С., Кулакова, О. Г., Данилова, Л. В., Батурина, О. А., Кабилов, М. Р., Попова, Е. В., Бойко, А. Н., Фаворова, О. О.

Аннотация: Выявлены дифференциально метилированные CpG-сайты (ДМС) генома CD4+ Т-лимфоцитов, характеризующих первично-прогрессирующий рассеянный склероз. Анализ представленности генов, содержащих ДМС, в основных биологических процессах показал их участие в формировании иммунного ответа, процессинге и презентации антигена, развитии иммунной системы, регуляции адгезии клеток к внеклеточному матриксу. Показана вовлеченность этой эпигенетической модификации в иммунопатогенез заболевания. Полученные данные могут помочь в углублении знаний об особенностях патогенеза этой тяжелой формы рассеянного склероза.

Памяти Вернаты Викторовны Гречко : (06.02.1930-06.12.2021 гг.). - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 528. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - фот.

Аннотация: 6 декабря 2021 года ушла из жизни профессор, доктор биологических наук Верната Викторовна Гречко. Представлена краткая биография ученого, внесшего большой вклад в развитие молекулярной биологии.

Лапа, С. А.
Новый метод оценки влияния модифицированных трифосфатов дезоксинуклеозидов на изменение состава комбинаторных библиотек для проведения SELEX / С. А. Лапа, О. С. Антипова, А. В. Чудинов. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 521-527. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 526-527 (20 назв.). - рис.

Авторы: Лапа, С. А., Антипова, О. С., Чудинов, А. В.

Аннотация: Предложен новый способ оценки субстратной эффективности дезоксинуклеозидтрифосфатов (dNTP), содержащих функциональные группы, для селекции модифицированных аптамеров. Метод предполагает проведение трех последовательных раундов ПЦР с комбинаторной библиотекой и модифицированным dNTP - кандидатом для проведения mod-SELEX. Вывод о применимости конкретного производного dNTP основан на характере изменения амплификационной кривой в течение трех раундов ПЦР в режиме реального времени и не требует проведения раундов селекции аптамеров.

Новые аналоги уридина как возможные противовирусные агенты, специфичные к SARS-COV-2 / А. А. Маслова, Е. С. Матюгина, Е. Ю. Шустова [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 510-515. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 515 (18 назв.). - рис.

Авторы: Маслова, А. А., Матюгина, Е. С., Шустова, Е. Ю., Волок, В. П., Козловская, Л. И., Кочетков, С. Н., Хандажинская, А. Л.

Аннотация: Проведено исследование с целью получения новых 5-замещенных производных уридина - потенциальных ингибиторов РНК-зависимой РНК-полимеразы коронавируса. Такие вещества получены с высоким выходом по реакции Сузуки-Мияуры и охарактеризованы с помощью современных физико-химических методов. Однако тестирование антивирусной активности этих веществ в отношении SARS-CoV-2 не выявило существенного ингибиторного эффекта.

Мультимодальная магнитно-резонансная и флуоресцентная визуализация трансплантации индуцированных плюрипотентных стволовых клеток в мозг / Y. C. Zhang, J. W. Wang, Y. Wu [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 500-502. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 502 (21 назв.).

Авторы: Zhang, Y. C., Wang, J. W., Wu, Y., Tao, Q., Wang, F. F., Wang, N., Ji, X. R., Li, Y. G., Yu, S., Zhang, J. Z.

Аннотация: Рассмотрены вопросы оптимизации клеточной терапии способом мультимодальной визуализации на анатомическом и молекулярном уровнях. Сконструирован лентивирусный вектор, несущий гены тяжелой цепи-1 ферритина (FTH1), флуоресцентного белка ближнего инфракрасного диапазона (iRFP) и усиленного зеленого флуоресцентного белка (EGFP). Создана культура индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (iPSCs), стабильно экспрессирующих эти три репортерных гена. Эти iPSCs флуоресцировали в зеленой и ближней инфракрасной области спектра, а также обладали способностью поглощать железо in vitro. После трансплантации меченых iPSCs в мозг крысы прижившиеся клетки можно было до 60 суток визуализировать in vivo с помощью магнитно-резонансной и флуоресцентной спектроскопии. Разработанную технологию можно рассматривать как новый инструмент для изучения поведения трансплантированных клеток мультимодальным способом.

МикроРНК miR-375 как многофункциональный регулятор сердечно-сосудистой системы / Н. А. Матвеева, Н. М. Баулина, И. С. Киселев [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 418-427. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 425-427 (59 назв.). - рис.

Авторы: Матвеева, Н. А., Баулина, Н. М., Киселев, И. С., Титов, Б. В., Фаворова, О. О.

Аннотация: МикроРНК miR-375 действует как многофункциональный регулятор активности многих физиологических и патологических клеточных процессов путем взаимодействия с большим числом генов-мишеней. Отмечено, что miR-375 может быть использована в качестве биомаркера и терапевтической мишени при некоторых заболеваниях. В обзоре рассмотрена роль miR-375 в функционировании сердечно-сосудистой системы в норме и при патологических состояниях.

Картирование регуляторных элементов в 5'- и 3'-нетранслируемых областях мРНК Siglec-15 с помощью репортерного анализа / L. Wang, R. Li, X. Lai [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 465-467. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 466-467 (39 назв.).

Авторы: Wang, L., Li, R., Lai, X., Zhang, X., Chen, H., Zhao, W.

Аннотация: Siglec-15 - иммунный супрессор, активируемый в различных типах злокачественных опухолей, рассматривается как новая потенциальная мишень для иммунотерапии опухолей. Представлены данные, дающие ключ к пониманию механизмов регуляции экспрессии гена Siglec-15.

Изменение уровней мРНК генов ДНК-метилтрансфераз в эндотелиальных клетках, обработанных митомицином / М. Ю. Синицкий, А. В. Синицкая, Д. К. Шишкова [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 491-497. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 496-497 (28 назв.). - рис., 2 табл.

Авторы: Синицкий, М. Ю., Синицкая, А. В., Шишкова, Д. К., Кутихин, А. Г., Минина, В. И., Понасенко, А. В.

Аннотация: Показано, что уровень метилирования ДНК изменяется под действием генотоксического стресса, вызванного различными кластогенными агентами. Генотоксический стресс, в свою очередь, является одним из триггеров эндотелиальной дисфункции. С помощью количественной полимеразной цепной реакции оценены изменения уровней мРНК генов DNMT1, DNMT3A и DNMT3B в линиях эндотелиальных клеток коронарной (HCAEC) и внутренней грудной (HITAEC) артерий человека, экспонированных алкилирующим мутагеном - митомицином С. Показано, что изменения уровней мРНК генов ДНК-метилтрансфераз могут вносить вклад в формирование эндотелиальной дисфункции в ответ на мутагенную нагрузку в эксперименте in vitro.

Бизяев, Н. С.
Динамика структуры мРНК эукариот в ходе трансляции / Н. С. Бизяев, Т. В. Егорова, Е. З. Алкалаева. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 451-464. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 460-464 (112 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Бизяев, Н. С., Егорова, Т. В., Алкалаева, Е. З.

Аннотация: В рамках обзора обобщено разнообразие экспериментальных данных и гипотез о связи пространственной структуры мРНК с ее трансляционной активностью. Сделан вывод, что элементы, находящиеся на противоположных концах мРНК, могут взаимодействовать и влиять друг на друга.

Тарасенко, Т. А.
Гетерогенность популяции митохондрий в клетках растений и других организмов / Т. А. Тарасенко, М. В. Кулинченко. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 391-417. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 409-417 (209 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Тарасенко, Т. А., Кулинченко, М. В.

Аннотация: Рассмотрены особенности организации и динамики хондриома клеток растений в сравнении с другими таксономическими группами организмов. Особое внимание уделено причинам и механизмам, ведущим к митохондриальной гетерогенности, феномену гетероплазмии у растений и возможности функциональной специализации у митохондрий, а также роли этих процессов для всего организма. Показано, что причиной неоднородного состояния митохондрий в клетке могут быть разные факторы, в том числе видоспецифические особенности процессов митохондриальной динамики, отвечающие за гомогенность популяции этих органелл клетки.

Володина, О. В.
Выбор донорной молекулы в экспериментах по геномному редактированию в клетках животных / О. В. Володина, С. А. Смирнихина. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 428-438. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 434-438 (70 назв.). - рис.

Авторы: Володина, О. В., Смирнихина, С. А.

Аннотация: Редактирование генома стало мощным инструментом изучения свойств генов или изменения нуклеотидной последовательности. Такие варианты репарации, как направленная гомологичная репарация (HDR) или репарация с помощью одноцепочечной матрицы (SSTR) позволяют вносить желаемые изменения в ген. Рассмотрены донорные молекулы, которые используют для репарации двухцепочечных разрывов с помощью HDR или SSTR при редактировании генома, их применение и модификации, повышающие эффективность HDR и SSTR.

MiR-485-3p и miR-4728-5p как супрессоры опухолевого роста в патогенезе колоректального рака / T. Gurer, A. Aytekin, E. Caki [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 516-520. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 518-520 (75 назв.).

Авторы: Gurer, T., Aytekin, A., Caki, E., Gezici, S., Минина, В. И., Понасенко, А. В.

Аннотация: MикрoРНК - класс малых некодирующих РНК, главные функции которых связаны с развитием и прогрессией колоректального рака (CRC), где они действуют как супрессоры опухолевого роста или онкогены. Изучена роль микроРНК miR-485-3p и miR-4728-5p в патогенезе CRC. Предположено, что снижение экспрессии miR-485-3p и miR-4728-5p может быть ассоциировано с развитием CRC.

Бизяев, Н. С.
HEMK-подобные метилтрансферазы в регуляции клеточных процессов / Н. С. Бизяев, А. В. Шувалов, Е. З. Алкалаева. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 439-450. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 447-450 (76 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Бизяев, Н. С., Шувалов, А. В., Алкалаева, Е. З.

Аннотация: Трансляционная метилтрансфераза (метилаза) HEMK2 человека, ортологи которой обнаружены у множества прокариот и эукариот, метилирует такие разнообразные субстраты, как остатки глутамина и лизина в составе белков, дезоксиаденозин в ДНК, а также соединения мышьяка. Рассмотрены особенности функционирования метилазы HEMK2 человека и ее ортологов как многофункциональных ферментов, регулирующих клеточные процессы, в частности, биосинтез белка.