Sheng, H.
Функциональная характеристика промотора гена ZmHAK1 кукурузы и регулирующих его факторов транскрипции / H. Sheng, D. L. Cong, H. Y. Ju. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 374-388. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 386-388 (53 назв.). - ил.

Авторы: Sheng, H., Cong, D. L., Ju, H. Y.

Аннотация: Исследовано взаимодействие промотора ZmHAK1 с факторами транскрипции ZmRAP2. 11 и ZmARF2. Изучена роль гена ZmHAK1 в процессе поглощения ионов калия и, возможно, в ответе растений кукурузы на абиотический стресс.

Котнова, А. П.
Сравнительный структурный анализ трех кластеров piРНК в геноме Drosophila melanogaster / А. П. Котнова, Ю. В. Ильин. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 426-434. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 432-433 (27 назв.). - ил.

Авторы: Котнова, А. П., Ильин, Ю. В.

Аннотация: Предпринята попытка ретроспективного воссоздания последовательности событий, приведших к образованию трех регуляторных piРНК-кластеров у Drosophila melanogaster. Исследованы piРНК-кластеры 20А, 38С и flamenco. Построены схемы их последовательного формирования и выявлены структурные особенности. Приведены доводы в пользу известной гипотезы о piРНК-кластерах как о “ловушках транспозонов”. Согласно этой модели, присутствие в геноме только одной копии транспозона свидетельствует о том, что его экспрессия была подавлена механизмами РНК-интерференции сразу после попадания мобильного элемента в piРНК-кластер. Приведены доказательства высокой структурной изменчивости piРНК-кластеров дрозофилы и событий горизонтального переноса мобильных элементов между родственными видами.

Сложность обнаружения гомологичной рекомбинации, опосредованной CRISPR/Cas9, у Danio rerio / Y. Pi, K. Z. He, W. Q. Zhang [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 435-444. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 443-444 (27 назв.). - ил., 3 табл.

Авторы: Pi, Y., He, K. Z., Zhang, W. Q., Dong, Z. Q., Jiang, F. G., Jiang, K. J., Guo, S.

Аннотация: Осуществлена попытка встроить при помощи системы CRISPR/Cas9 репортерный ген GFP в геномный локус gad полосатого данио. Дано подробное описание методики проводимого исследования. Полученные результаты позволяют предположить, что низкая эффективность гомологичной рекомбинации, наблюдаемая в экспериментах по CRISPR-опосредованному встраиванию последовательностей в локус gad, частично может объясняться потерей вставки после интеграции в геном.

Роль естественного отбора в формировании генетической структуры популяций по SNP-маркерам, связанным с индексом массы тела и ожирением / Е. А. Трифонова, А. А. Попович, А. В. Бочарова [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 398-411. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 407-410 (81 назв.). - ил., 2 табл.

Авторы: Трифонова, Е. А., Попович, А. А., Бочарова, А. В., Вагайцева, К. В., Степанов, В. А.

Аннотация: Изучены структура и возможные механизмы генетической дифференциации наследственной компоненты ожирения. Подтверждена роль естественного отбора в формировании генетической структуры популяций человека по SNP-маркерам, ассоциированным с индексом массы тела и ожирением.

Поддержание плазмидной экспрессии in vivo зависит главным образом от содержания CpG-мотивов в векторе и трансгене / А. В. Брутер, М. В. Калашникова, А. П. Притыко, А. В. Белявский. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 487-496. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 494-496 (43 назв.). - ил.

Авторы: Брутер, А. В., Калашникова, М. В., Притыко, А. П., Белявский, А. В.

Аннотация: Генная терапия с использованием плазмидных векторов - безопасная и относительно недорогая терапевтическая стратегия, однако быстрое подавление экспрессии трансгена в тканях значительно снижает ее эффективность. Представлены результаты анализа долговременной экспрессии секретируемой щелочной фосфатазы мыши и ее варианта, лишенного CpG-динуклеотидов, в мышцах задних конечностей и печени мышей. Для длительной экспрессии трансгенов плазмидными векторами в печени содержание CpG как в векторе, так и в трансгене должно быть существенно снижено, тогда как для продолжительной экспрессии в скелетных мышцах достаточно минимизации содержания CpG-мотивов в векторе. Локализация S/MAR-элементов внутри транскрипционной единицы, в отличие от локализации вне ее, приводит к значительному снижению уровня секретируемых, но не цитоплазматических белков.

Тиллиб, С. В.
Перспективы использования однодоменных антител в биомедицине / С. В. Тиллиб. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 362-373. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 369-372 (82 назв.). - ил.

Авторы: Тиллиб, С. В.

Аннотация: Рассмотрены недавно опубликованные данные об использовании нанотел в диагностике и разработке новых иммунотерапевтических средств. Обсуждены перспективы использования нанотел в качестве адресных молекул компонентов микробиоты, а также поиска перспективных мишеней для ранней диагностики с помощью нанотел.

Модификация 5 '-конца лидерной последовательности мРНК приводит к изменению набора факторов, требуемых для инициации трансляции / П. А. Сахаров, Е. А. Согорин, С. Ч. Агаларов, В. А. Колб. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 480-486. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 485-486 (15 назв.). - ил.

Авторы: Сахаров, П. А., Согорин, Е. А., Агаларов, С. Ч., Колб, В. А.

Аннотация: Исследована инициация на мРНК с "обелиновым лидером", 5'-конец которого модифицирован добавлением участка, состоящего из 45 дезоксицитидиловых и 10 уридиловых нуклеотидов. Образование рибосомных 48S инициаторных комплексов на стартовом кодоне такой модифицированной мРНК изучено с помощью метода ингибирования удлинения праймера. Оказалось, что, в отличие от мРНК с неизмененной лидерной последовательностью, инициация на мРНК с модифицированным лидером может происходить в отсутствие фактора eIF4F, хотя и с меньшей эффективностью. Обнаруженное явление указывает на неизученную функцию фактора eIF4F, проявляемую на начальном этапе узнавания мРНК инициирующей рибосомной субчастицей.

Uluisik, I.
Модификации неоднозначных оснований антикодона тРНК и устойчивость дрожжей к борной кислоте: в резистентных к бору делеционных мутантах активирован механизм общего контроля аминокислот и эффлюкс бора / I. Uluisik, H. C. Karakaya, А. Koc. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 450-456. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 455-456 (34 назв.). - ил.

Авторы: Uluisik, I., Karakaya, H. C., Koc, А.

Аннотация: Охарактеризованы гены, делеция которых обеспечивает устойчивость дрожжей к бору. Проанализированы механизмы, лежащие в основе этой устойчивости. Обнаружено, что во всех устойчивых к бору мутантах конститутивно активирован путь общего аминокислотного контроля и экспрессия гена ATR1, вследствие чего в них снижена внутриклеточная концентрация бора и повышена устойчивость к его токсичным уровням.

Исследование фертильности линии Drosophila melanogaster MS с нарушением контроля транспозиции мобильного элемента gypsy / И. В. Кукушкина, П. А. Махновский, Л. Н. Нефедова [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 412-425. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 423-424 (54 назв.). - ил., 4 табл.

Авторы: Кукушкина, И. В., Махновский, П. А., Нефедова, Л. Н., Балакирева, Е. А., Романова, Н. И., Кузьмин, И. В., Лавренов, А. Р., Ким, А. И.

Аннотация: Изучен феномен сниженной плодовитости линии Drosophila melanogaster MS, характеризующейся нарушением контроля транспозиции мобильных генетических элементов и наличием функциональной и активно перемещающейся копии ретротранспозона gypsy. Проведен сравнительный анализ транскриптомов линии MS и контрольных линий, направленный на поиск генетических маркеров, коррелирующих с репродуктивными особенностями линии MS.

Егоров, Е. Е.
Здоровое старение: антиоксиданты, разобщители и/или теломераза? / Е. Е. Егоров. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 355-361. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 358-360 (55 назв.).

Авторы: Егоров, Е. Е.

Аннотация: Согласно свободно-радикальной теории старения, активные формы кислорода признаются одним из патогенетических факторов старения, особенно патологий, ассоциированных со старением. Изучена активация разобщения окислительного фосфорилирования свободными жирными кислотами. Кроме антиоксидантов и разобщителей, способностью снижать уровень активных форм кислорода обладает также теломераза, механизм действия которой мало изучен, но известно, что в условиях окислительного стресса теломераза транспортируется внутрь митохондрий и улучшает выживаемость клеток за счет снижения продукции активных форм кислорода.

Замена гидроксилированного остатка His39 в рибосомном белке uL15 на остаток Ala или Thr нарушает трансляционную активность рибосом человека / Д. Д. Яньшина, А. В. Гопаненко, Г. Г. Карпова, А. А. Малыгин. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 512-521. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 519-520 (27 назв.). - ил., табл.

Авторы: Яньшина, Д. Д., Гопаненко, А. В., Карпова, Г. Г., Малыгин, А. А.

Аннотация: С помощью анализа структурной модели рибосомы человека сделано предположение о роли гидроксильной группы на His39 в локальной стабилизации структуры рибосомы через образование водородной связи между этой группой и атомом азота имидазольного кольца His40. Учитывая, что His39 располагается вблизи E-сайта рибосомы, выдвинута гипотеза о том, что такая стабилизация структуры рибосомы обеспечивает поддержание ее трансляционной активности.

Драйверные мутации при остром миелоидном лейкозе с инверсией хромосомы 16 / Л. Г. Гукася, Г. С. Краснов, О. В. Муравенко [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 389-397. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 395-397 (32 назв.). - ил., 2 табл.

Авторы: Гукася, Л. Г., Краснов, Г. С., Муравенко, О. В., Иконникова, А. Ю., Юрасов, Р. А., Байдун, Л. В., Ибрагимова, С. З., Наседкина, Т. В.

Аннотация: Проведен поиск драйверных мутационных событий в лейкозных клетках, содержащих химерный ген CBFB-MYH11, который образуется при инверсии хромосомы 16. С использованием таргетного обогащения исследованы кодирующие участки 84 генов у 12 детей, больных острым миелоидным лейкозом с инверсией хромосомы 16. Обнаружены соматические мутации в генах белков внутриклеточных сигнальных каскадов рецепторных тирозинкиназ, таких как KIT, NRAS, KRAS, FLT3. Роль мутаций в патогенезе заболевания оценена с помощью сравнительного анализа образцов, взятых в момент диагностики и в период ремиссии. Выявлены ранее не описанные мутации в генах KDM6, NOTCH1, IDH1, которые могут быть вовлечены в процессы возникновения и развития лейкоза.

Гены рРНК дрозофилы образуют устойчивые контакты с геном Tlk в области экспрессии малых РНК и влияют на организацию петлевых доменов / О. В. Кретова, Д. М. Федосеева, И. Ю. Словохотов [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 445-449. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 448-449 (12 назв.). - ил.

Авторы: Кретова, О. В., Федосеева, Д. М., Словохотов, И. Ю., Клушевская, Е. С., Кравацкий, Ю. В., Чуриков, Н. А.

Аннотация: Отмечено, что гены рРНК играют важную роль в дифференцировке и эпигенетической регуляции многих других генов. Конкретные места контактов генов рРНК и их роль в геноме дрозофилы изучены с использованием метода 4С. Обнаружено, что ген Tlk, расположенный в Х-хромосоме, образует частые контакты с генами рРНК. Гены Tlk и Rala, имеющие общую промоторную область, заметно отличаются активностью экспрессии. Показано, что петлевые домены хромосом образуются вокруг мест контактов генов рРНК в гене Tlk. Сделан вывод о том, что эпигенетическая регуляция с участием генов рРНК может адресно направляться малыми РНК, а контакты генов рРНК вовлечены в изменения трехмерных структур хроматина.

Высокая экспрессия Sp1, CSF1R и PAK1 коррелирует с повышенной чувствительностью лейкозных клеток к антибиотику Митрамицину / Э. Р. Вагапова, Т. Д. Лебедев, А. Д. Тихонова [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 522-528. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 527 (16 назв.). - ил., табл.

Авторы: Вагапова, Э. Р., Лебедев, Т. Д., Тихонова, А. Д., Гойхман, Б. В., Иваненко, К. А., Спирин, П. В., Прасолов, В. С.

Аннотация: Исследована экспрессия Sp1 в клетках лейкоза человека и выявлены гены, экспрессия которых коррелирует с уровнем Sp1. Полученные результаты подтверждены на перевиваемых клетках лейкоза человека, дана оценка их чувствительности к Митрамицину - препарату, конкурентно связывающему мишени Sp1 на ДНК.

Li, J. J.
Влияние SGI-1027 на формирование и элиминацию PrP{Sc} в инфицированных прионом клетках / J. J. Li, C. S. Ryou, D. H. Kim. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 469-473. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 472-473 (15 назв.). - ил.

Авторы: Li, J. J., Ryou, C. S., Kim, D. H.

Аннотация: Результаты исследования подтверждают, что в нейронах, инфицированных прионом болезни хронического истощения, под действием SGI-1027 происходит элиминация PrP{Sc}. Точно определена область связывания прионного белка человека с SGI-1027, который широко используется против различных типов прионных заболеваний, включая вызванные прионами человека. На основании полученных результатов сделан вывод, что элиминация патогенного PrP{Sc} под действием SGI-1027 не зависит от DNMT.

pH-чувствительный калиевый канал TASK-1 - хемосенсор центральной регуляции дыхания у крыс / Q. Q. Li, K. X. Wan, M. S. Xu [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 457-468. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 466-468 (38 назв.). - ил.

Авторы: Li, Q. Q., Wan, K. X., Xu, M. S., Wang, L. M., Zhang, Y. Y., Wang, C. T., Mao, F. X., Zhu, J. L., Pan, Z. M., Gao, R.

Аннотация: Исследована экспрессия мРНК TASK-1 в нейронах, связанных с дыханием в стволе мозга, и возможные регуляторные механизмы TASK-1 в центральной хеморегуляции дыхания у крыс. Полученные результаты расширяют понимание возможной функции каналов TASK-1 в дыхательном центре.

Cтруктура нейроглобина холодноводной губки Halisarca dujardinii / К. И. Адамейко, О. И. Кравчук, А. Д. Финошин [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 474-479. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 477-478 (19 назв.). - ил., табл.

Авторы: Адамейко, К. И., Кравчук, О. И., Финошин, А. Д., Бончук, А. Н., Георгиев, А. А., Михайлов, В. С., Горностаев, Н. Г., Михайлов, К. В., Бачева, А. В., Индейкина, М. И., Бугрова, А. Е., Газизова, Г. Р., Козлова, О. С., Гусев, О. А., Шагимарданова, Е. И., Люпина, Ю. В.

Аннотация: С использованием секвенирования ДНК и РНК изучена структура гена нейроглобина холодноводной морской губки Halisarca dujardinii. Получен рекомбинантный белок Ngb H. dujardinii, предсказанная аминокислотная последовательность которого подтверждена с помощью спектрометрического и хромато-масс-спектрометрического анализа.

Cys-фланкированные катионные пептиды для доставки гена тимидинкиназы вируса простого герпеса в клетки с целью суицидной генной терапии миомы матки / А. А. Егорова, С. В. Штыкалова, М. А. Маретина [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 3. - С. 497-511. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 508-510 (56 назв.). - ил., 2 табл.

Авторы: Егорова, А. А., Штыкалова, С. В., Маретина, М. А., Селютин, А. В., Швед, Н. Ю., Крылова, Н. В., Ильина, А. В., Пьянков, И. А., Фрейнд, С. А., Сельков, С. А., Баранов, В. С., Киселев, А. В.

Аннотация: Изучена проблема выбора носителя генетической конструкции при генной терапии миомы матки. Исследованы комплексы ДНК с Arg-богатыми пептидными носителями, которые получены двумя различными способами полимеризации за счет образования межпептидных цистиновых связей. Рассмотрены физико-химические свойства полученных комплексов, их транспорт внутрь клетки, токсичность и трансфекционная эффективность in vitro. Проведено моделирование суицидной генной терапии миомы матки путем переноса в первичные клетки, полученные из миоматозных узлов, гена тимидинкиназы вируса простого герпеса типа 1, с последующей оценкой их пролиферативной активности после обработки ганцикловиром.