Эффективность активации генов при помощи систем трансактивации на основе CRISPR/dCas9 зависит от времени работы системы / А. С. Артюхов, Д. А. Доровский, А. В. Сорокина [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 1014-1022. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 1021-1022 (17 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Артюхов, А. С., Доровский, Д. А., Сорокина, А. В., Шакирова, К. М., Момотюк, Е. Д., Дашинимаев, Э. Б.

Аннотация: Одно из перспективных приложений, возникших на основе системы CRISPR/Cas9 - активаторные системы, которые позволяют прицельно управлять уровнем экспрессии генов интереса в исследуемых клетках. Однако по имеющимся данным эффективность их работы может значительно изменяться в зависимости от типа клеток и используемой активаторной системы. Изучена эффективность трех активаторных систем - dCas9-VP160, dCas9-SunTag и dCas9-VPR - в линии иммортализованных фибробластов кожи человека для активации экспрессии генов OCT4, NANOG, PDX1, FOXA2, NKX2-2, NKX6-1. Показано, что эффективность активации этих генов зависит от типа активаторной системы, а сила активации - от времени работы активаторной системы.

Экспрессия белка LAMP1 человека повышает продукцию вирусов SARS-COV-1 И SARS-COV-2 в трансгенных клеточных линиях на основе Vero / А. А Дольский, И. В. Грищенко, С. А. Боднев [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 3. - С. 503-509. - ISSN 0026-8984. - URL: https://www.elibrary.ru/contents.asp?id=48340164. - Библиогр.: с. 508 (23 назв.). - рис.

Авторы: Дольский, А. А, Грищенко, И. В., Боднев, С. А., Назаренко, А. А., Смирнова, А. М., Матвеева, А. К., Булычев, Л. Е., Овчинникова, А. С., Трегубчак, Т. В., Зайковская, А. В., Иматдинов, И. Р., Пьянков, О. В., Гаврилова, Е. В., Максютов, Р. А, Юдкин, Д. В.

Аннотация: Созданы трансгенные клеточные линии на основе клеток Vero с повышенной экспрессией гена LAMP1 человека, проанализирована их чувствительность к заражению и репликативная активность SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2. Обнаружено повышение продукции обоих вирусов в трансгенных клетках по сравнению с исходной клеточной культурой, особенно при заражении клеток в присутствии трипсина. На основании полученных данных предположено, что LAMP1 способствует репликации SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 за счет усиления экзоцитоза.

Валеева, Л. Р.
Цис-пренилтрансферазы Marchantia polymorpha: филогенетический анализ и перспективы использования в качестве регуляторов синтеза антимикробных соединений / Л. Р. Валеева, С. М. Джабраилова, М. Р. Шарипова. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 969-982. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 981-982 (33 назв.). - рис., 2 табл.

Авторы: Валеева, Л. Р., Джабраилова, С. М., Шарипова, М. Р.

Аннотация: Полиизопренолы растений синтезируются цис-пренилтрансферазами (CPTs), поэтому изучение этих ферментов необходимо для понимания путей синтеза, локализации и функций полиизопренолов растений. К уникальной группе растений, обладающей большим потенциалом для проведения исследований CPTs, относятся бриофиты, в том числе печеночный мох Marchantia polymorpha. Проведен биоинформатический анализ генов CPTs в геноме бриофита M. polymorpha и идентифицировано семь, гомологичных генам AtCPT7 и AtCPT3 Arabidopsis thaliana, участвующим в синтезе полиизопренолов. Получены четыре индивидуальные линии растений-мутантов M. polymorpha по гену MpCPT7. 37. Показано, что в трех линиях мутация приводила к сдвигу рамки считывания и нокауту этого гена. Однако нокаут только одной из CPTs типа 7 не оказывал влияния на рост и выживаемость растений. Выявлено, что антибактериальная активность экстрактов тканей растений-мутантов значимо не отличалась от растений дикого типа, что указывает на возможный компенсаторный эффект, обусловленный активностью других CPTs типа 7.

Фотоотверждаемые пленки на основе фиброина и желатина для регенерации кожных покровов / М. С. Котлярова, А. С. Солдатенко, А. Ю. Архипова [и др.]. - Текст : электронный
// Вестник Московского университета. Сер. 16, Биология. - 2020. - № 1. - С. 23-30. - ISSN 0201-7385. - URL: https://elibrary.ru/contents.asp?id=42490417. - Библиогр.: с. 28-29 (20 назв.). - ил., диагр.

Авторы: Котлярова, М. С., Солдатенко, А. С., Архипова, А. Ю., Бессонов, И. В., Давыдова, Л. И., Мойсенович, А. М., Богуш, В. Г., Дебабов, В. Г., Штиль, А. А., Мойсенович, М. М., Шайтан, К. В.

Аннотация: Изготовлены фотополимеризуемые пленки на основе фиброина шелка и метакрилированного желатина, которые могут применяться в качестве раневых покрытий, а также как основа для создания искусственной кожи. Было оценено их взаимодействие с фибробластами и кератиноцитами - основными типами клеток, участвующих в регенерации, - а также влияние свойств материала на процесс восстановления ткани в модели полнослойной раны кожи мыши.

Белицкий, Г. А. (доктор медицинских наук; Рос. онкологический науч. центр им. Н. Н. Блохина РАМН).
Трансмиссивные клоны злокачественных клеток / Г. А. Белицкий, М. Г. Якубовская
// Природа. - 2012. - № 12. - С. 15-26. - Библиогр.: с. 26 (15 назв. ). - 8 рис., 3 табл.

Авторы: Белицкий, Г. А., Якубовская, М. Г.

Аннотация: Об изучении результатов трансплантации опухолевых клеток у человека и животных.

Сухих, И. С.
Трансгенез в червях: претенденты на идеальную модель / И. С. Сухих, М. Ю. Бирюков, А. Г. Блинов. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 983-989. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 987-989 (41 назв.). - 1 табл.

Авторы: Сухих, И. С., Бирюков, М. Ю., Блинов, А. Г.

Аннотация: Трансгенез - важный и зачастую необходимый метод для изучения многих процессов жизнедеятельности животных. Чтобы создать линии трансгенных животных, необходимы подходящие модельные организмы, которые имели бы полезные особенности для эффективного и доступного трансгенеза. В обзоре охарактеризованы существующие модельные организмы различных таксонов червей, для которых показан эффективный метод трансгенеза. Особое внимание уделено плоским червям, в частности, Macrostomum lignano как перспективному модельному организму для изучения процессов старения, регенерации и канцерогенеза.

Тест-система для оценки активности мутантных вариантов Cas9 в дрожжах Saccharomyces cerevisiae / Д. С. Спасская, А. И. Давлетшин, В. В. Тютяева [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 937-948. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 946-947 (42 назв.). - рис., 4 табл.

Авторы: Спасская, Д. С., Давлетшин, А. И., Тютяева, В. В., Кулагин, К. А., Гарбуз, Д. Г., Карпов, Д. С.

Аннотация: С целью разработки простого метода для высокопроизводительного скрининга Cas9-мутантов in vivo охарактеризованы три тест-системы, использующие CRISPR/Cas9-опосредованную инактивацию репортерных генов tsPurple, ADE2 и URA3 в дрожжах Saccharomyces cerevisiae как в модельном объекте. В экспериментах измерены активности высокоточных форм evoCas9 и HiFiCas9 по отношению к белку дикого типа. Установлено, что наиболее валидным способом оценки активности Cas9 служит метод с инактивацией гена ADE2. В полученной тест-системе показана чувствительность высокоточных вариантов Cas9 к структуре хроматина. Предложенная тест-система может быть применима в разработке редакторов генома нового поколения.

Сфероиды на основе клеточной линии легкого эмбриона человека (ЛЭЧ-3) и их использование для накопления вируса простого герпеса типа 1 / И. А. Иващенко, О. С. Федотова, И. А. Короткова [и др.]. - Текст : электронный
// Биотехнология. - 2024. - Т. 40, № 5. - С. 3-10. - ISSN 0234-2758. - Библиогр.: с. 9-10 (29 назв. ).

Авторы: Иващенко, И. А., Федотова, О. С., Короткова, И. А., Михайленко, Ю. А., Василевский, В. В., Остапчук, А. В., Панова, А. Е.

Аннотация: Сконструирована биологическая модель на основе 3D-сфероидов из клеточной линии легких эмбрионов человека (ЛЭЧ-3) и проведена ее апробация на примере анализа репликативной активности вируса простого герпеса типа 1, штамм L2 (ВПГ-1/L2).

Цымбал, С. А.
Супрессор опухолей p53 и метаболизм меди: малоизвестная, но важная связь / С. А. Цымбал, А. Г. Рефельд, О. А. Кучур. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 1057-1071. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 1066-1071 (111 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Цымбал, С. А., Рефельд, А. Г., Кучур, О. А.

Аннотация: Баланс окислительно-восстановительных реакций и судьба опухолевой клетки тесно связаны с регуляцией внутриклеточного гомеостаза переходных металлов, среди которых исключительно важную роль играют медь и ее соединения. Все больше исследований подтверждает, что взаимодействие медьсодержащих соединений и белков метаболизма меди с фактором p53 многогранно и не замыкается исключительно на генерации активных форм кислорода. Рассмотрена связь транскрипционного фактора p53 с метаболическими путями, регулирующими распределение меди, и возможность использования этой взаимосвязи для повышения эффективности онкотерапии.

Загоскин, А. А.
Структурные элементы векторов на основе ДНК и РНК для доставки геномных редакторов в клетки высших эукариот in vitro и in vivo / А. А. Загоскин, М. В. Захарова, М. О. Нагорных. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 1023-1038. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 1035-1038 (68 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Загоскин, А. А., Захарова, М. В., Нагорных, М. О.

Аннотация: Одним из наиболее важных вопросов совершенствования технологий редактирования генетической информации, особенно в контексте терапевтического применения, остается вопрос доставки редакторов в клетки и ткани, а также управляемой и безопасной экспрессии этих трансгенов. В настоящий момент существуют системы вирусной и невирусной доставки. В представленном обзоре рассмотрены структурные элементы невирусных экспрессионных векторов на основе ДНК и РНК, используемых в генном редактировании, а также способы доставки этих векторов in vitro и in vivo.

Радчук, Р.
Страшная смесь / Руслана Радчук ; беседу провела Алиса Вячеславова
// Вокруг света. - 2014. - № 4. - С. 138. - ISSN 0321-0669. - ил.

Авторы: Радчук, Р.

Аннотация: Научный сотрудник отдела молекулярной генетики Руслана Радчук развенчивает мифы о вреде генно-модифицированных растений.

Сахно, Н. Г. (ФГБУ "Научный центр экспертизы средств медицинского применения" Минздрава России (Москва)).
Стимулчувствительные системы доставки генотерапевтических лекарственных препаратов / Н. Г. Сахно, О. В. Гунар. - Текст : электронный
// Биотехнология. - 2024. - Т. 40, № 2. - С. 68-83. - ISSN 0234-2758. - Библиогр.: с. 77-83 (129 назв. ).

Авторы: Сахно, Н. Г., Гунар, О. В.

Аннотация: Представлены актуальные сведения о существующих методах генной терапии и генотерапевтических препаратах, одобренных к применению, а также находящихся на стадии разработки и клинических исследований. Рассмотрены этапы разработки препаратов, а также способы направленной доставки генетического материала в клетки и ткани.

Сравнительное изучение термической перестройки вирусов с икосаэдрическим и спиральным типом симметрии / Е. А. Трифонова [и др.]
// Вестник Московского университета. Сер. 16, Биология. - 2017. - № 4. - С. 209-214. - ISSN 0201-7385. - https://elibrary.ru/contents.asp?id=34538343. - Библиогр.: с. 212-213 (24 назв.). - ил.

Авторы: Трифонова, Е. А., Никитин, Н. А., Архипенко, М. В., Донченко, Е. К., Атабеков, И. Г., Карпова, О. В.

Аннотация: Изучена возможность получения структурно модифицированных частиц при термической перестройке вирионов икосаэдрических и спиральных вирусов, относящихся к различным таксономическим группам.

Чун Яту.
Спор о генетически модифицированных продуктах / Чун Яту, Юй Дэцин, Лань Мин
// Китай. - 2013. - № 12. - С. 6-7. - ISSN 1005-5010. - 1 рис.

Авторы: Чун Яту, Юй Дэцин, Лань Мин

Аннотация: Дискуссия о генно-модифицированных продуктах в китайском обществе.

Состояние сигнального пути Jak/STAT влияет на чувствительность опухолевых клеток к онколитическим энтеровирусам / Т. Х. Ле, А. В. Липатова, М. А. Вольская [и др.]. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2020. - Т. 54, № 4. - С. 634-642. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 641-642 (24 назв.). - ил., 2 табл.

Авторы: Ле, Т. Х., Липатова, А. В., Вольская, М. А., Тихонова, О. А., Чумаков, П. М.

Аннотация: Определен вклад интерфероновой системы в восприимчивость опухолевых клеток к онколитическим энтеровирусам и к их способности реплицироваться в зараженных клетках. Показано, что нарушения сигнального пути Jak/STAT в опухолевых клетках приводят к общему повышению чувствительности к действию онколитических вирусов.

Сложная динамика в системах альтернативного сплайсинга мРНК: математическая модель / В. В. Когай [и др.]
// Вычислительные технологии. - 2015. - Т. 20, № 1. - С. 38-52. - ISSN 1560-7534. - Загл., аннот. парал. рус. англ. с. 51-52. - Библиогр.: с. 50-51 (19 назв.). - рис.

Авторы: Когай, В. В., Хлебодарова, Т. М., Фадеев, С. И., Лихошвай, В. А.

Аннотация: Рассматривается простейшая математическая модель, состоящая из двух дифференциальных уравнений с запаздывающими аргументами, описывающая генетическую систему альтернативного сплайсинга, в результате чего синтезируются две изоформы белка, одна из которых является активатором, а другая - ингибитором инициации транскрипции. Для численного анализа динамических свойств модели предложен эффективный метод редукции проблемы к краевой задаче с условиями периодичности для системы обыкновенных дифференциальных уравнений, структура которой определяется заданием запаздываний.

Репарация двухцепочечных разрывов ДНК, генерируемых CRISPR-Cas9 в Pseudomonas putida KT2440 / Н. Шараев, L. Chacon-Machado, О. Мушарова [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 914. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека".

Авторы: Шараев, Н., Chacon-Machado, L., Мушарова, О., Савицкая, Е., Северинов, К.

Аннотация: Pseudomonas putida KT2440 - метаболически универсальная бактерия со значительными перспективами в качестве основного штамма для производства и переработки сложных органических соединений. В отличие от большинства бактерий, P. putida KT2440 кодирует белки Ku и LigD, участвующие в негомологичном соединении концов (NHEJ). Исследован эффект делеции или сверхэкспрессии NHEJ-ассоциированных ферментов P. putida KT2440 на мутациях, генерируемых при репарации Cas9-опосредованных DSB, с двойной целью - охарактеризовать NHEJ и изучить, как он функционально взаимодействует с текущим “золотым стандартом” редактирования генов. Результаты работы проливают свет на нематричные механизмы репарации DSB у P. putida KT2440. Представленная информация послужит основой для расширения инструментария генной инженерии этого важного микроорганизма.

Редактирование геномов представителей трибы Пшеницевые с использованием системы CRISPR/Cas / Б. Р. Кулуев, Е. В. Михайлова, А. Р. Кулуев [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 949-968. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 962-967 (105 назв.). - 1 табл.

Авторы: Кулуев, Б. Р., Михайлова, Е. В., Кулуев, А. Р., Галимова, А. А., Заикина, Е. А., Хлесткина, Е. К.

Аннотация: К трибе Triticeae (Пшеницевые) относятся такие важнейшие сельскохозяйственные культуры, как пшеница мягкая, пшеница твердая, ячмень, рожь и тритикале. Исследования в области обратной генетики и генная инженерия Пшеницевых получили новый импульс, когда началось активное применение системы геномного редактирования CRISPR/Cas. В настоящем обзоре собраны и проанализированы данные о недавних успехах геномного редактирования культурных растений трибы Triticeae и используемом для этого инструментарии.

Профилактическая вакцинация мезенхимальными стволовыми клетками защищает мышей от летальной инфекции, вызванной вирусом простого герпеса 1 типа / Р. Р. Климова, Н. А. Демидова, О. В. Масалова, А. А. Кущ. - Текст : непосредственный
// Молекулярная биология. - 2021. - Т. 55, № 3. - С. 478-490. - ISSN 0026-8984. - Библиогр.: с. 487-489 (49 назв.). - ил., 2 табл.

Авторы: Климова, Р. Р., Демидова, Н. А., Масалова, О. В., Кущ, А. А.

Аннотация: Представлены результаты сравнительного анализа протективного иммунного ответа на введение профилактических кандидатных вакцин на основе мезенхимальных стволовых клеток, ДНК-плазмиды и инактивированного вируса в отношении летальной инфекции мышей, вызванной вирусом простого герпеса 1 типа.

Противовирусное действие рибонуклеопротеиновых комплексов CRISPR/Cas9 на модели вируса гепатита В in vivo / А. П. Костюшева, С. А. Брезгин, Н. И. Пономарева [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 884-891. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 889-890 (22 назв.). - рис.

Авторы: Костюшева, А. П., Брезгин, С. А., Пономарева, Н. И., Гоптарь, И. А., Никифорова, А. В., Гегечкори, В. И., Полуэктова, В. Б., Туркадзе, К. А., Судьина, А. Е., Чуланов, В. П., Костюшев, Д. С.

Аннотация: К числу наиболее перспективных для полной элиминации вируса гепатита В (ВГВ) из организма относятся подходы на основе CRISPR/Cas9. На модели ВГВ у мышей in vivo изучено противовирусное действие комплексов высокоспецифичного белка Cas9 и РНК-проводника, направленных на геном ВГВ. Показано, что однократная инъекция короткоживущих рибонуклеопротеиновых комплексов CRISPR/Cas9 снижает уровни ДНК ВГВ в сыворотке и печени мышей примерно в 10 раз, при этом в оставшихся ДНК ВГВ детектируются редкие мутации по типу вставок и делеций. Создание препаратов для лечения хронического гепатита В на основе рибонуклеопротеиновых комплексов CRISPR/Cas9 в перспективе может существенно сократить сроки лечения и привести к полной элиминации вируса из организма.