Эффективность активации генов при помощи систем трансактивации на основе CRISPR/dCas9 зависит от времени работы системы / А. С. Артюхов, Д. А. Доровский, А. В. Сорокина [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 1014-1022. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 1021-1022 (17 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Артюхов, А. С., Доровский, Д. А., Сорокина, А. В., Шакирова, К. М., Момотюк, Е. Д., Дашинимаев, Э. Б.

Аннотация: Одно из перспективных приложений, возникших на основе системы CRISPR/Cas9 - активаторные системы, которые позволяют прицельно управлять уровнем экспрессии генов интереса в исследуемых клетках. Однако по имеющимся данным эффективность их работы может значительно изменяться в зависимости от типа клеток и используемой активаторной системы. Изучена эффективность трех активаторных систем - dCas9-VP160, dCas9-SunTag и dCas9-VPR - в линии иммортализованных фибробластов кожи человека для активации экспрессии генов OCT4, NANOG, PDX1, FOXA2, NKX2-2, NKX6-1. Показано, что эффективность активации этих генов зависит от типа активаторной системы, а сила активации - от времени работы активаторной системы.

Валеева, Л. Р.
Цис-пренилтрансферазы Marchantia polymorpha: филогенетический анализ и перспективы использования в качестве регуляторов синтеза антимикробных соединений / Л. Р. Валеева, С. М. Джабраилова, М. Р. Шарипова. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 969-982. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 981-982 (33 назв.). - рис., 2 табл.

Авторы: Валеева, Л. Р., Джабраилова, С. М., Шарипова, М. Р.

Аннотация: Полиизопренолы растений синтезируются цис-пренилтрансферазами (CPTs), поэтому изучение этих ферментов необходимо для понимания путей синтеза, локализации и функций полиизопренолов растений. К уникальной группе растений, обладающей большим потенциалом для проведения исследований CPTs, относятся бриофиты, в том числе печеночный мох Marchantia polymorpha. Проведен биоинформатический анализ генов CPTs в геноме бриофита M. polymorpha и идентифицировано семь, гомологичных генам AtCPT7 и AtCPT3 Arabidopsis thaliana, участвующим в синтезе полиизопренолов. Получены четыре индивидуальные линии растений-мутантов M. polymorpha по гену MpCPT7. 37. Показано, что в трех линиях мутация приводила к сдвигу рамки считывания и нокауту этого гена. Однако нокаут только одной из CPTs типа 7 не оказывал влияния на рост и выживаемость растений. Выявлено, что антибактериальная активность экстрактов тканей растений-мутантов значимо не отличалась от растений дикого типа, что указывает на возможный компенсаторный эффект, обусловленный активностью других CPTs типа 7.

Фотоотверждаемые пленки на основе фиброина и желатина для регенерации кожных покровов / М. С. Котлярова, А. С. Солдатенко, А. Ю. Архипова [и др.]. - Текст : электронный
// Вестник Московского университета. Сер. 16, Биология. - 2020. - № 1. - С. 23-30. - ISSN 0201-7385. - URL: https://elibrary.ru/contents.asp?id=42490417. - Библиогр.: с. 28-29 (20 назв.). - ил., диагр.

Авторы: Котлярова, М. С., Солдатенко, А. С., Архипова, А. Ю., Бессонов, И. В., Давыдова, Л. И., Мойсенович, А. М., Богуш, В. Г., Дебабов, В. Г., Штиль, А. А., Мойсенович, М. М., Шайтан, К. В.

Аннотация: Изготовлены фотополимеризуемые пленки на основе фиброина шелка и метакрилированного желатина, которые могут применяться в качестве раневых покрытий, а также как основа для создания искусственной кожи. Было оценено их взаимодействие с фибробластами и кератиноцитами - основными типами клеток, участвующих в регенерации, - а также влияние свойств материала на процесс восстановления ткани в модели полнослойной раны кожи мыши.

Белицкий, Г. А. (доктор медицинских наук; Рос. онкологический науч. центр им. Н. Н. Блохина РАМН).
Трансмиссивные клоны злокачественных клеток / Г. А. Белицкий, М. Г. Якубовская
// Природа. - 2012. - № 12. - С. 15-26. - Библиогр.: с. 26 (15 назв. ). - 8 рис., 3 табл.

Авторы: Белицкий, Г. А., Якубовская, М. Г.

Аннотация: Об изучении результатов трансплантации опухолевых клеток у человека и животных.

Сухих, И. С.
Трансгенез в червях: претенденты на идеальную модель / И. С. Сухих, М. Ю. Бирюков, А. Г. Блинов. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 983-989. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 987-989 (41 назв.). - 1 табл.

Авторы: Сухих, И. С., Бирюков, М. Ю., Блинов, А. Г.

Аннотация: Трансгенез - важный и зачастую необходимый метод для изучения многих процессов жизнедеятельности животных. Чтобы создать линии трансгенных животных, необходимы подходящие модельные организмы, которые имели бы полезные особенности для эффективного и доступного трансгенеза. В обзоре охарактеризованы существующие модельные организмы различных таксонов червей, для которых показан эффективный метод трансгенеза. Особое внимание уделено плоским червям, в частности, Macrostomum lignano как перспективному модельному организму для изучения процессов старения, регенерации и канцерогенеза.

Тест-система для оценки активности мутантных вариантов Cas9 в дрожжах Saccharomyces cerevisiae / Д. С. Спасская, А. И. Давлетшин, В. В. Тютяева [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 937-948. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 946-947 (42 назв.). - рис., 4 табл.

Авторы: Спасская, Д. С., Давлетшин, А. И., Тютяева, В. В., Кулагин, К. А., Гарбуз, Д. Г., Карпов, Д. С.

Аннотация: С целью разработки простого метода для высокопроизводительного скрининга Cas9-мутантов in vivo охарактеризованы три тест-системы, использующие CRISPR/Cas9-опосредованную инактивацию репортерных генов tsPurple, ADE2 и URA3 в дрожжах Saccharomyces cerevisiae как в модельном объекте. В экспериментах измерены активности высокоточных форм evoCas9 и HiFiCas9 по отношению к белку дикого типа. Установлено, что наиболее валидным способом оценки активности Cas9 служит метод с инактивацией гена ADE2. В полученной тест-системе показана чувствительность высокоточных вариантов Cas9 к структуре хроматина. Предложенная тест-система может быть применима в разработке редакторов генома нового поколения.

Цымбал, С. А.
Супрессор опухолей p53 и метаболизм меди: малоизвестная, но важная связь / С. А. Цымбал, А. Г. Рефельд, О. А. Кучур. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 1057-1071. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 1066-1071 (111 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Цымбал, С. А., Рефельд, А. Г., Кучур, О. А.

Аннотация: Баланс окислительно-восстановительных реакций и судьба опухолевой клетки тесно связаны с регуляцией внутриклеточного гомеостаза переходных металлов, среди которых исключительно важную роль играют медь и ее соединения. Все больше исследований подтверждает, что взаимодействие медьсодержащих соединений и белков метаболизма меди с фактором p53 многогранно и не замыкается исключительно на генерации активных форм кислорода. Рассмотрена связь транскрипционного фактора p53 с метаболическими путями, регулирующими распределение меди, и возможность использования этой взаимосвязи для повышения эффективности онкотерапии.

Загоскин, А. А.
Структурные элементы векторов на основе ДНК и РНК для доставки геномных редакторов в клетки высших эукариот in vitro и in vivo / А. А. Загоскин, М. В. Захарова, М. О. Нагорных. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 1023-1038. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 1035-1038 (68 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Загоскин, А. А., Захарова, М. В., Нагорных, М. О.

Аннотация: Одним из наиболее важных вопросов совершенствования технологий редактирования генетической информации, особенно в контексте терапевтического применения, остается вопрос доставки редакторов в клетки и ткани, а также управляемой и безопасной экспрессии этих трансгенов. В настоящий момент существуют системы вирусной и невирусной доставки. В представленном обзоре рассмотрены структурные элементы невирусных экспрессионных векторов на основе ДНК и РНК, используемых в генном редактировании, а также способы доставки этих векторов in vitro и in vivo.

Радчук, Р.
Страшная смесь / Руслана Радчук ; беседу провела Алиса Вячеславова
// Вокруг света. - 2014. - № 4. - С. 138. - ISSN 0321-0669. - ил.

Авторы: Радчук, Р.

Аннотация: Научный сотрудник отдела молекулярной генетики Руслана Радчук развенчивает мифы о вреде генно-модифицированных растений.

Сахно, Н. Г. (ФГБУ "Научный центр экспертизы средств медицинского применения" Минздрава России (Москва)).
Стимулчувствительные системы доставки генотерапевтических лекарственных препаратов / Н. Г. Сахно, О. В. Гунар. - Текст : электронный
// Биотехнология. - 2024. - Т. 40, № 2. - С. 68-83. - ISSN 0234-2758. - Библиогр.: с. 77-83 (129 назв. ).

Авторы: Сахно, Н. Г., Гунар, О. В.

Аннотация: Представлены актуальные сведения о существующих методах генной терапии и генотерапевтических препаратах, одобренных к применению, а также находящихся на стадии разработки и клинических исследований. Рассмотрены этапы разработки препаратов, а также способы направленной доставки генетического материала в клетки и ткани.

Чун Яту.
Спор о генетически модифицированных продуктах / Чун Яту, Юй Дэцин, Лань Мин
// Китай. - 2013. - № 12. - С. 6-7. - ISSN 1005-5010. - 1 рис.

Авторы: Чун Яту, Юй Дэцин, Лань Мин

Аннотация: Дискуссия о генно-модифицированных продуктах в китайском обществе.

Сложная динамика в системах альтернативного сплайсинга мРНК: математическая модель / В. В. Когай [и др.]
// Вычислительные технологии. - 2015. - Т. 20, № 1. - С. 38-52. - ISSN 1560-7534. - Загл., аннот. парал. рус. англ. с. 51-52. - Библиогр.: с. 50-51 (19 назв.). - рис.

Авторы: Когай, В. В., Хлебодарова, Т. М., Фадеев, С. И., Лихошвай, В. А.

Аннотация: Рассматривается простейшая математическая модель, состоящая из двух дифференциальных уравнений с запаздывающими аргументами, описывающая генетическую систему альтернативного сплайсинга, в результате чего синтезируются две изоформы белка, одна из которых является активатором, а другая - ингибитором инициации транскрипции. Для численного анализа динамических свойств модели предложен эффективный метод редукции проблемы к краевой задаче с условиями периодичности для системы обыкновенных дифференциальных уравнений, структура которой определяется заданием запаздываний.

Репарация двухцепочечных разрывов ДНК, генерируемых CRISPR-Cas9 в Pseudomonas putida KT2440 / Н. Шараев, L. Chacon-Machado, О. Мушарова [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 914. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека".

Авторы: Шараев, Н., Chacon-Machado, L., Мушарова, О., Савицкая, Е., Северинов, К.

Аннотация: Pseudomonas putida KT2440 - метаболически универсальная бактерия со значительными перспективами в качестве основного штамма для производства и переработки сложных органических соединений. В отличие от большинства бактерий, P. putida KT2440 кодирует белки Ku и LigD, участвующие в негомологичном соединении концов (NHEJ). Исследован эффект делеции или сверхэкспрессии NHEJ-ассоциированных ферментов P. putida KT2440 на мутациях, генерируемых при репарации Cas9-опосредованных DSB, с двойной целью - охарактеризовать NHEJ и изучить, как он функционально взаимодействует с текущим “золотым стандартом” редактирования генов. Результаты работы проливают свет на нематричные механизмы репарации DSB у P. putida KT2440. Представленная информация послужит основой для расширения инструментария генной инженерии этого важного микроорганизма.

Редактирование геномов представителей трибы Пшеницевые с использованием системы CRISPR/Cas / Б. Р. Кулуев, Е. В. Михайлова, А. Р. Кулуев [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 949-968. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 962-967 (105 назв.). - 1 табл.

Авторы: Кулуев, Б. Р., Михайлова, Е. В., Кулуев, А. Р., Галимова, А. А., Заикина, Е. А., Хлесткина, Е. К.

Аннотация: К трибе Triticeae (Пшеницевые) относятся такие важнейшие сельскохозяйственные культуры, как пшеница мягкая, пшеница твердая, ячмень, рожь и тритикале. Исследования в области обратной генетики и генная инженерия Пшеницевых получили новый импульс, когда началось активное применение системы геномного редактирования CRISPR/Cas. В настоящем обзоре собраны и проанализированы данные о недавних успехах геномного редактирования культурных растений трибы Triticeae и используемом для этого инструментарии.

Прокариотические белки-Аргонавты как инструмент биотехнологии / Е. В. Кропочева, Л. А. Лисицкая, А. А. Агапов [и др.]. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 915-936. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 929-936 (203 назв.). - рис., 1 табл.

Авторы: Кропочева, Е. В., Лисицкая, Л. А., Агапов, А. А., Мусабиров, А. А., Кульбачинский, А. В., Есюнина, Д. М.

Аннотация: Программируемые нуклеазы - важнейший инструмент для манипуляций с генами и геномами прокариот и эукариот. С конца XX века ведется разработка подходов к направленному изменению конкретных участков генома без модификации остальной ДНК. В обзоре кратко рассмотрены достоинства и недостатки основных известных на сегодня генетических редакторов. Основное внимание уделено программируемым нуклеазам из семейства прокариотических белков-Аргонавтов. Эти белки узнают и расщепляют определенные последовательности ДНК с использованием коротких комплементарных молекул-гидов и играют важную роль в защите клеток прокариот от чужеродной ДНК. Белки-Аргонавты уже нашли применение в биотехнологии для направленного расщепления и детекции нуклеиновых кислот и потенциально могут быть использованы для редактирования геномов.

Синицын, А. П. (Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук (Москва) ; МГУ им. М. В. Ломоносова. Химический факультет (Москва)).
Получение промышленно важных ферментов на основе экспрессионной системы гриба Penicillium verruculosum / А. П. Синицын, О. А. Синицына, А. М. Рожкова. - Текст : непосредственный
// Биотехнология. - 2020. - Т. 36, № 6. - С. 17-34. - ISSN 0234-2758. - Библиогр.: с. 31-33 (71 назв. ).

Авторы: Синицын, А. П., Синицына, О. А., Рожкова, А. М.

Аннотация: Проанализирована возможность использования экспрессионной системы Penicillium verruculosum для получения промышленно важных ферментов.

Волчков, П. Ю. (Московский физико-технический институт).
Поколение генетически неуязвимых / Павел Волчков ; [беседовал] Виталий Лейбин. - Текст : непосредственный
// Эксперт. - 2021. - № 36. - С. 42-47. - ISSN 1812-1896. - цв. фот.

Авторы: Волчков, П. Ю.

Аннотация: Интервью с заведующим лабораторией геномной инженерии Московского физико-технического института о технологических прорывах в современной генетике, борьбе со старением, генетической профилактике, позволяющей предотвращать некоторые заболевания, а также его научной деятельности в России и США.

Суворова, Ю. М. (Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук" (Москва)).
Поиск сильно дивергировавших SINE повторов в геноме риса / Ю. М. Суворова, А. М. Камионская, Е. В. Коротков. - Текст : электронный
// Биотехнология. - 2020. - Т. 36, № 4. - С. 15-20. - ISSN 0234-2758. - URL: https://elibrary.ru/contents.asp?id=43798222. - Библиогр.: с. 19-20 (15 назв. ).

Авторы: Суворова, Ю. М., Камионская, А. М., Коротков, Е. В.

Аннотация: Представлен новый метод поиска размытых копий SINE повторов в геномных последовательностях, основанный на учете корреляции соседних символов, как при построении позиционно весовой матрицы, так и при проведении сканирования, что позволяет увеличить алфавит и соответственно разрешающую способность метода.

Мамонтова, А. В.
Перспективы генетически кодируемых FLIM-индикаторов для количественной оценки внутриклеточных параметров / А. В. Мамонтова, Т. Р. Симонян, А. М. Богданов. - Текст : электронный
// Молекулярная биология. - 2022. - Т. 56, № 6. - С. 1039-1043. - ISSN 0026-8984. - Тема номера: "Редактирование геномов: от вирусов до клеток человека". - Библиогр.: с. 1042 (15 назв.). - рис.

Авторы: Мамонтова, А. В., Симонян, Т. Р., Богданов, А. М.

Аннотация: Сделан краткий обзор принципов детекции флуоресцентного сигнала генетически кодируемых индикаторов с акцентом на актуальных подходах, связанных с анализом времяразрешенных данных.

Оптимизация условий лабораторного культивирования клеток СНО для получения генно-инженерного фолликулостимулирующего гормона человека / Д. М. Павленко [и др.]
// Биотехнология. - 2018. - Т. 34, № 1. - С. 73-80. - ISSN 0234-2758. - Режим доступа: https://elibrary.ru/contents.asp?id=34844802. - Библиогр.: с. 78-79 (20 назв. ).

Авторы: Павленко, Д. М., Карягина, Т. Б., Гукасова, Е. А., Орехова, Н. Е., Швец, В. И.

Аннотация: Проведена оптимизация условий культивирования в биореакторе клеточной линии CHO, производящей фолликулостимулирующий гормон.